RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 MANBALQ9NQG1 85 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 BET1LQ9NYM9 111 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IGSF23A1L1A6 192 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR6C6A6NF89 314 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR2T8A6NH00 312 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZFP92A6NM28 416 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CDS2O95674 445 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ID1P41134 155 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR51I2Q9H344 312 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 R4GMQ9 66 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CACNA1CQ13936 2221 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 MPDZO75970 2070 aa6.44□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RNF212BA8MTL3 300 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C3orf80F5H4A9 247 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CCL21O00585 134 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SRPXP78539 464 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 Q6ZN92 141 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NIT1Q86X76 327 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 KBTBD11O94819 623 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IGKV3-15P01624 115 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 KITLGP21583 273 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SPATA45Q537H7 98 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LGI3Q8N145 548 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZNF709Q8N972 641 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 WDR31Q8NA23 367 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GATSQ8NAP1 163 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 BTF3L4Q96K17 158 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 VDAC3Q9Y277 283 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ACACAQ13085 2346 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CXCL13O43927 109 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RHBDL1O75783 438 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TESK1Q15569 626 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CALHM1Q8IU99 346 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NAA60Q9H7X0 242 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM140Q9NV12 185 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.43□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C19orf84I3L1E1 186 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TSPOP30536 169 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ARFRP1Q13795 201 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 GABRA6Q16445 453 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 ZNF787Q6DD87 383 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TRIB1Q96RU8 372 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TM2D1Q9BX74 207 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 EMC9Q9Y3B6 208 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR7C2O60412 319 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IGLC1P0CG04 106 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 AADACP22760 399 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 IL3RAP26951 378 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 RUNX1Q01196 453 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.42□□□□□ -1.38
USP4-211ENST00000485450 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.42□□□□□ -1.38
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