RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 SULT1A2P50226 295 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 PAX5Q02548 391 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SPSB4Q96A44 273 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 BOD1Q96IK1 185 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 ACTL6BO94805 426 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 TRGC2P03986 189 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 IL24Q13007 206 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF665Q9H7R5 613 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 CREBBPQ92793 2442 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 ZG16O60844 167 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRNQ5BIV9 151 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM50AO95807 157 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SMAGPQ0VAQ4 97 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 PYY3Q5JQD4 70 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 Q8IYB0 196 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM171Q8WVE6 324 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SSMEM1Q8WWF3 244 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 SMIM12Q96EX1 92 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM210BQ96KR6 192 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 GCM1Q9NP62 436 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 CDS2O95674 445 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 MPZP25189 248 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 NAAAQ02083 359 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 NHLH1Q02575 133 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT14Q96FL9 552 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 C18orf12Q96KH6 178 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 EREGO14944 169 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 NAPSAO96009 420 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5G3P0C626 314 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 EGR1P18146 543 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 CD200P41217 278 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 BORCS7Q96B45 105 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 VSIRQ9H7M9 311 aa11.4□□□□□ -0.58
RABGEF1-210ENST00000437078 OR7C2O60412 319 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 STARD4Q96DR4 205 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PPV4 95 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV2-70P01814 119 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 IL36GQ9NZH8 169 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM157CP0CG43 387 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 MMP9P14780 707 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR82Q6UXN9 313 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 S1PR3Q99500 378 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GW15 77 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 DLX1P56177 255 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4F5Q8NH21 305 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4C12Q96R67 309 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4F4Q96R69 305 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF835Q9Y2P0 537 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 LYNX1G3V0Z9 82 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 H0Y980 276 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 CA11O75493 328 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 LYNX1P0DP58 116 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 ACP7Q6ZNF0 438 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 Q6ZR03 302 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 R3HDM4Q96D70 268 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 RBFOX3A6NFN3 312 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 PGA5P0DJD9 388 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM216AQ8WUB2 273 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 SEC11CQ9BY50 192 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGEF1-210ENST00000437078 OOEPA6NGQ2 149 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms