RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 C10orf55Q5SWW7 151 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM45BPQ6NSW5 357 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 XKRXQ6PP77 449 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C1orf174Q8IYL3 243 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C15orf53Q8NAA6 179 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 IMMP2LQ96T52 175 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRRG3Q9BZD7 231 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 METTL9Q9H1A3 318 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRABDQ9H4I3 376 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASCL3Q9NQ33 180 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 PARVAQ9NVD7 372 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 LHFPL6Q9Y693 200 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 USP24Q9UPU5 2620 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TONSLQ96HA7 1378 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ORC5O43913 435 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 NEMFO60524 1076 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATP5G1P05496 136 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 MSMBP08118 114 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADORA1P30542 326 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSMD7P51665 324 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RAB14P61106 215 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 STX3Q13277 289 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C9orf64Q5T6V5 341 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM173BQ6P4H8 233 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 COPS6Q7L5N1 327 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 DHFR2Q86XF0 187 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPHB5Q86YW7 130 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 BAP18Q8IXM2 172 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF439Q8NDP4 499 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR8B3Q8NGG8 313 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR10D3Q8NH80 312 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 CYTH2Q99418 400 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM208Q9BTX3 173 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 POFUT2Q9Y2G5 429 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 EML5Q05BV3 1969 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 STRCQ7RTU9 1775 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A087WX48 190 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 DAPL1A0PJW8 107 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C5orf49A4QMS7 147 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 STX10O60499 249 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNFAIP8O95379 198 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ASS1P00966 412 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCL5P13501 91 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 F8A1P23610 371 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 DDTP30046 118 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL28P46779 137 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 FXYD2P54710 66 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPS24P62847 133 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 HPCAP84074 193 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 GNA13Q14344 377 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFA5Q16718 116 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TEX36Q5VZQ5 186 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 BLIDQ8IZY5 108 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR5L1Q8NGL2 311 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 LRRC45Q96CN5 670 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 C19orf60Q96EN9 201 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBP7Q96R05 134 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 REG4Q9BYZ8 158 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TTTY13Q9BZ97 58 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 HES4Q9HCC6 221 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 RIMS2Q9UQ26 1411 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 GLI3P10071 1580 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PP64 1363 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 FLT4P35916 1363 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM94Q12767 1356 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 H3BT86 120 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 APOMO95445 188 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 METTL15P1P0C7V9 234 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRGC1P0CF51 173 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 MSNP26038 577 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 LCN1P31025 176 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLCO1A2P46721 670 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLAMF1Q13291 335 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 CDK10Q15131 360 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF565Q8N9K5 539 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 TESCQ96BS2 214 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 PPCDCQ96CD2 204 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 NMNAT3Q96T66 252 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-407P-201ENST00000365280 SERPINI1Q99574 410 aa0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms