RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DS2P43631 304 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS7P47929 136 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TAS2R19P59542 299 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP10-11P60412 298 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN5P62079 268 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DYRK1AQ13627 763 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MEF2DQ14814 521 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ECSCRQ19T08 205 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM65Q6PI78 240 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00299Q6ZSB3 139 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF383Q8NA42 475 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 POC5Q8NA72 575 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MYOZ3Q8TDC0 251 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM4Q8WVI0 70 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SNAPC3Q92966 411 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.98□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 K7EIL1 84 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FCN1O00602 326 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PPYP01298 95 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DMAP28067 261 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 HRH1P35367 487 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00205P59089 165 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CX3CL1P78423 397 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 CATR1Q13166 79 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FHL3Q13643 280 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PSG5Q15238 335 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR5M8Q8NGP6 311 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 OR52I2Q8NH67 350 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 KLK15Q9H2R5 256 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 VSIG4Q9Y279 399 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.97□□□□□ -1.45
SGMS1-201ENST00000361543 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PN81 502 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MEIS3P1A6NDR6 274 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 DISC1C4P0D8 188 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.461e-7■□□□□ 8.5
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A17O43808 307 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CA2P00918 260 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 AADACP22760 399 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF8P32971 234 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CHRNA7P36544 502 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ETV6P41212 452 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RAB9AP51151 201 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 RUNX1Q01196 453 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PYDC2Q56P42 97 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD9Q7L273 389 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A6Q8IZM9 456 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR11H1Q8NG94 326 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR4S2Q8NH73 311 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ARPC1AQ92747 370 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 MOB3AQ96BX8 217 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf30Q96GV9 206 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 HARBI1Q96MB7 349 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 OR5B12Q96R08 314 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 CLCC1Q96S66 551 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD1Q96SE0 405 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 PRRT1Q99946 306 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.96□□□□□ -1.46
SGMS1-201ENST00000361543 GNB4Q9HAV0 340 aa5.96□□□□□ -1.46
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