RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 KCNS1Q96KK3 526 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 SRD5A2P31213 254 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 GNG3P63215 75 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 C19orf35Q6ZS72 473 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 TXN2Q99757 166 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 RARRES3Q9UL19 164 aa16.09■□□□□ 0.17
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1W2PN81 502 aa16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CCL25O15444 150 aa16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 OR10J4P0C629 311 aa16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 UBE2G2P60604 165 aa16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 KRTDAPP60985 99 aa16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 NRN1Q9NPD7 142 aa16.08■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ZG16O60844 167 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CER1O95813 267 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 Q6ZN92 141 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 GGNQ86UU5 652 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF738Q8NE65 137 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 LINC00470Q9BZP3 86 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SNURFLB1AK76 121 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SSR4P51571 173 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PRRX1P54821 245 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 KRTCAP3Q53RY4 240 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PNKDQ8N490 385 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 WDR54Q9H977 334 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 GNB4Q9HAV0 340 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 MED12Q93074 2177 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CFAP54Q96N23 3096 aa16.07■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PGPEP1LA6NFU8 196 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 Q8IYB0 196 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SLC25A45Q8N413 288 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 COX11Q9Y6N1 276 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 DMXL1Q9Y485 3027 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 J3QT63 122 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CDIPTO14735 213 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 BMP5P22003 454 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PLA2G5P39877 138 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PMCHL1Q16048 86 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 MMD2Q8IY49 270 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 BET1LQ9NYM9 111 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SPEGQ15772 3267 aa16.06■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SCO2A0A1W2PP80 73 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TRAPPC6AO75865 159 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 G6PCP35575 357 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 IER3P46695 156 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 AARDQ4LEZ3 155 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SAP25Q8TEE9 199 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TAAR6Q96RI8 345 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.05■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 C15orf62A8K5M9 175 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 GDF9O60383 454 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 MT-CO2P00403 227 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 AREGP15514 252 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 AMTP48728 403 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 G3V3Y1 287 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ARL14EPLP0DKL9 152 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 TMPRSS3P57727 454 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CX3CL1P78423 397 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 MRGPRDQ8TDS7 321 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 UHRF2Q96PU4 802 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RNF114Q9Y508 228 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 PIEZO1Q92508 2521 aa16.04■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 CXCL13O43927 109 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 S1PR2O95136 353 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RAC2P15153 192 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 RHOBP62745 196 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 HTD2P86397 168 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 APH1AQ96BI3 265 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 V9GYV3 84 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 DPRXA6NFQ7 191 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 F2Z2F3 143 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 K7EN84 100 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF488Q96MN9 340 aa16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.02■□□□□ 0.16
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1W2PR80 420 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms