RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 CTRLP40313 264 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CEACAM16Q2WEN9 425 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 FGF21Q9NSA1 209 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 TIMM9Q9Y5J7 89 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 EPOPA6NHQ4 379 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 GNG7O60262 68 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 AAED1Q7RTV5 226 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 SMIM12Q96EX1 92 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 OR2D2Q9H210 308 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 hDV102S1A0JD36 115 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 OR5B21A6NL26 309 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 ZIC3O60481 467 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CTSSP25774 331 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 GAGE10A6NGK3 116 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 PPBPP02775 128 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 HIST3H3Q16695 136 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 WDR73Q6P4I2 378 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 TSKUQ8WUA8 353 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 NABP1Q96AH0 204 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 A0A1B0GX78 115 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CRYBB3P26998 211 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CD1BP29016 333 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 LGALS4P56470 323 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 UBE2G1P62253 170 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 Q0VG73 95 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 PSG7Q13046 419 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 TNXAQ16473 311 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 STPG3Q8N7X2 389 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 OR7C2O60412 319 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 IGLV3-1P01715 115 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 PPOXP50336 477 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 CENPWQ5EE01 88 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 LTBP2Q14767 1821 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRR-201ENST00000283228 C5orf49A4QMS7 147 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 TMPRSS2O15393 492 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 MFAP2P55001 183 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 LINC00205P59089 165 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SELENOVP59797 346 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF585BQ52M93 769 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 DRAM1Q8N682 238 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 Q8N976 141 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 NINJ1Q92982 152 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC1BQ9P126 229 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.59□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 HELTA6NFD8 242 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR4C46A6NHA9 309 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 K7EN84 100 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ZFAND5O76080 213 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FGF12P61328 243 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PSG9Q00887 426 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PCSK4Q6UW60 755 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 A0A087X0K7 114 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 PPIAL4DF5H284 164 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CER1O95813 267 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FAM27BQ5VT28 67 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 OR5B3Q8NH48 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FOXB1Q99853 325 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 MT-CO2P00403 227 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 NPY1RP25929 384 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SSX8Q7RTT4 187 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 FRYLO94915 3013 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 BMPR1BO00238 502 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 SYNGR3O43761 229 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 CXorf1O96002 111 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRR-201ENST00000283228 IGHV3-13P01766 116 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms