RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 RTP5Q14D33 572 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 P2RY6Q15077 328 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 C3AR1Q16581 482 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 TANC1Q9C0D5 1861 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 WDR31Q8NA23 367 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.78□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 C4orf51C9J302 202 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 COL10A1Q03692 680 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PRD5 423 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PRF3 423 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PRM7 423 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 C7orf71A4D174 169 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 OR8B2Q96RD0 313 aa8.77□□□□□ -1
TTL-201ENST00000233336 GAB4Q2WGN9 574 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 GLRX2Q9NS18 164 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 RPRMQ9NS64 109 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TMEM250H0YL14 139 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 HYPMO75409 117 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 CKS2P33552 79 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 FOXS1O43638 330 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 CITED1Q99966 193 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 CENPWQ5EE01 88 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 MDP1Q86V88 176 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 MMD2Q8IY49 270 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SPSB4Q96A44 273 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PPE3 182 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TM4SF20Q53R12 229 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TEX29Q8N6K0 151 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SLC17A3O00476 420 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 OR8G5Q8NG78 346 aa8.77□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 MAS1LP35410 378 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 FGFRL1Q8N441 504 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 RNF222A6NCQ9 220 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 J3KRW8 73 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TYMSP04818 313 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 ZNF735P0CB33 412 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 K7N7A8 449 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 RND1Q92730 232 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 OR4C13Q8NGP0 309 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 MAGEA5P43359 124 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 KLF4O43474 513 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 AGFG2O95081 481 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 VENTXO95231 258 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 LINC00869P0C866 280 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 ASPHD2Q6ICH7 369 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TSPAN2O60636 221 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 FHL5Q5TD97 284 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 PLAUP00749 431 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 CEACAM3P40198 252 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 PSG4Q00888 419 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 GFRALQ6UXV0 394 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 UNC119Q13432 240 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 TMEM189A5PLL7 270 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 LIPFP07098 398 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 REG1BP48304 166 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.75□□□□□ -1.01
TTL-201ENST00000233336 HIST1H2BKO60814 126 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms