RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 TSKSQ9UJT2 592 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO3Q9UK99 471 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa8.56□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SPDYE2BA6NHP3 402 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 EYA2O00167 538 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 GNAI3P08754 354 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SPDYE6P0CI01 402 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 FGFR2P21802 821 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 NF2P35240 595 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 VPS37DQ86XT2 251 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 RASAL3Q86YV0 1011 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 LAMB1P07942 1786 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CLRN2A0PK11 232 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 MYO1BO43795 1136 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 MS4A1P11836 297 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 BCAMP50895 628 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 MVPQ14764 893 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CSRNP1Q96S65 589 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 COPRSQ9NQ92 184 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 AOX1Q06278 1338 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 AK9Q5TCS8 1911 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CIAO1O76071 339 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC5A1P13866 664 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 PRKG1Q13976 671 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 GRIK5Q16478 980 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 PANK1Q8TE04 598 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SSH3Q8TE77 659 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 LPIN2Q92539 896 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SIL1Q9H173 461 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 VEZTQ9HBM0 779 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 RNF186Q9NXI6 227 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 OTOFQ9HC10 1997 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 SSC5DA1L4H1 1573 aa8.52□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 MYH2Q9UKX2 1941 aa8.52□□□□□ -1.04
EFTUD2-210ENST00000588340 TRPA1O75762 1119 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 CRKP46108 304 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 RRP1P56182 461 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 RASA3Q14644 834 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 MAP3K11Q16584 847 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 MRIQ9BWK5 157 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 FZD1Q9UP38 647 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 GNAI2P04899 355 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFAIP1Q13829 316 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP2B3Q16720 1220 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 TEKT1Q969V4 418 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.51□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 UNCXA6NJT0 531 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 SRGAP3O43295 1099 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 TM4SF4P48230 202 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP8B2P98198 1209 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 CEP85Q6P2H3 762 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 SIRT2Q8IXJ6 389 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 ABHD8Q96I13 439 aa8.5□□□□□ -1.05
EFTUD2-210ENST00000588340 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms