RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	HMMR	O75330	724 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE6	P0CI01	402 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	MAP2K2	P36507	400 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		15.23	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	AIDA	Q96BJ3	306 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	GPR108	Q9NPR9	543 aa		15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	SEMA3E	O15041	775 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ADORA1	P30542	326 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	TIMM10	P62072	90 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	TFCP2	Q12800	502 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		15.21	■□□□□ 0.03
RBM23-231	ENST00000557549	PHKA1	P46020	1223 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CRK	P46108	304 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	LBX1	P52954	281 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	FKBP1B	P68106	108 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	AAMP	Q13685	434 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PRKG1	Q13976	671 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	VEZT	Q9HBM0	779 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	FZD1	Q9UP38	647 aa		15.2	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GUL7	405 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	MYO1B	O43795	1136 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	NOG	Q13253	232 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC102A	Q96A19	550 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	SLC10A3	P09131	477 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	NF2	P35240	595 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	IFFO2	Q5TF58	517 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15.18	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	RASA3	Q14644	834 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC102B	Q68D86	513 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	XAGE2	Q96GT9	111 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		15.17	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	RAB11FIP3	O75154	756 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TNNI3K	Q59H18	835 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TEKT1	Q969V4	418 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	MRI	Q9BWK5	157 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	MAST3	O60307	1309 aa		15.16	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	PRDX5	P30044	214 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CACNB3	P54284	484 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	TNS4	Q8IZW8	715 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	CSRNP1	Q96S65	589 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	RNF39	Q9H2S5	420 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		15.15	■□□□□ 0.02
RBM23-231	ENST00000557549	IGSF3	O75054	1194 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	GORAB	Q5T7V8	394 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	TEPSIN	Q96N21	525 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		15.14	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
RBM23-231	ENST00000557549	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01

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