RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552620.1

CHMP4A-210, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 2

Gene CHMP4A, Length 716 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-210ENST00000552620 RTN1Q16799 776 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SULT6B1Q6IMI4 303 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 MEIOBQ8N635 442 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CITED4Q96RK1 184 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CPS1P31327 1500 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TTC21AQ8NDW8 1320 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 UPP2O95045 317 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SMPD1P17405 629 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 PKDCCQ504Y2 493 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CEP85Q6P2H3 762 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 USP26Q9BXU7 913 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 BABAM1Q9NWV8 329 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 AKAP12Q02952 1782 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ARHGEF10O15013 1369 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TNRQ92752 1358 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 C3P01024 1663 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM83GA6ND36 823 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 FAM187AA6NFU0 413 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TNFRSF10BO14763 440 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 REC8O95072 547 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 DCTN1Q14203 1278 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 DIP2BQ9P265 1576 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 DLG5Q8TDM6 1919 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ACEP12821 1306 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CRB1P82279 1406 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 UNCXA6NJT0 531 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 MCM2P49736 904 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 DGKZQ13574 1117 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 MLECQ14165 292 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 HIF1AQ16665 826 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RTL1A6NKG5 1358 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ITSN1Q15811 1721 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RGS12O14924 1447 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 USP6P35125 1406 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ATP10DQ9P241 1426 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ERC2O15083 957 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 GNAI3P08754 354 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SDSP20132 328 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 FGD1P98174 961 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TMC7Q7Z402 723 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 CHMP4AQ9BY43 222 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SSH2Q76I76 1423 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SPINT1O43278 529 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 FZD6O60353 706 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 GNAI2P04899 355 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 USP5P45974 858 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 PLA2G4AP47712 749 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 MCM10Q7L590 875 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 HPS1Q92902 700 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 IFT43Q96FT9 208 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TSPYL4Q9UJ04 414 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 TBX22Q9Y458 520 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP4A-210ENST00000552620 EID1Q9Y6B2 187 aa7.28□□□□□ -1.24
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