RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 CIAO1O76071 339 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D8O95759 1140 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 IL1R1P14778 569 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 RGS19P49795 217 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 SOX10P56693 466 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 SIL1Q9H173 461 aa23.08■■□□□ 1.29
PUF60-218ENST00000531995 MMP14P50281 582 aa23.07■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 CFAP100Q494V2 611 aa23.07■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.07■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 VEZTQ9HBM0 779 aa23.07■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 FBXO3Q9UK99 471 aa23.07■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.06■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 SPDYE2BA6NHP3 402 aa23.05■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 SPDYE6P0CI01 402 aa23.05■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.05■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 PDE8BO95263 885 aa23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 GYG1P46976 350 aa23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 METTL24Q5JXM2 366 aa23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 HTTP42858 3142 aa23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.04■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 MYO1BO43795 1136 aa23.03■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 SREBF2Q12772 1141 aa23.03■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 MTMR14Q8NCE2 650 aa23.03■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.03■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 FGFR2P21802 821 aa23.02■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
PUF60-218ENST00000531995 TM4SF4P48230 202 aa23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 UBE4AQ14139 1066 aa23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 MFSD14BQ5SR56 506 aa23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 SPRYD7Q5W111 196 aa23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.01■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 GPR25O00155 361 aa22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 TFCP2Q12800 502 aa22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.99■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 WNK4Q96J92 1243 aa22.98■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.98■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 CENPFP49454 3210 aa22.97■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 RASA3Q14644 834 aa22.97■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K11Q16584 847 aa22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.96■■□□□ 1.27
PUF60-218ENST00000531995 GRIK5Q16478 980 aa22.95■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 HMMRO75330 724 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 TIMM10P62072 90 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 AAMPQ13685 434 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 VPS37DQ86XT2 251 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 LPIN2Q92539 896 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.94■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 FKTNO75072 461 aa22.93■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 GJA5P36382 358 aa22.93■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 CRKP46108 304 aa22.93■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 ATP2B3Q16720 1220 aa22.93■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 IFNL1Q8IU54 200 aa22.93■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.92■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 TNFAIP1Q13829 316 aa22.92■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.92■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 DCTPP1Q9H773 170 aa22.92■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 ADORA1P30542 326 aa22.91■■□□□ 1.26
PUF60-218ENST00000531995 BCAMP50895 628 aa22.91■■□□□ 1.26
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