RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 GJA5P36382 358 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 MAP3K9P80192 1104 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 PTPN18Q99952 460 aa14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 F6X3S4 739 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 CRKP46108 304 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 VGLL4Q14135 290 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 BEND3Q5T5X7 828 aa14.59□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CMTM1-211ENST00000528484 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.59□□□□□ -0.07
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CMTM1-211ENST00000528484 ZNF333Q96JL9 665 aa14.59□□□□□ -0.07
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CMTM1-211ENST00000528484 VAMP4O75379 141 aa14.58□□□□□ -0.08
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CMTM1-211ENST00000528484 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 WDR63Q8IWG1 891 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.58□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 ALDH1L1O75891 902 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 GNRH1P01148 92 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 CETPP11597 493 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
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CMTM1-211ENST00000528484 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 TEKT1Q969V4 418 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 MAST3O60307 1309 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.57□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 SNAPC2Q13487 334 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 DCAF15Q66K64 600 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 ERO1BQ86YB8 467 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 AOX1Q06278 1338 aa14.56□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 PRMT2P55345 433 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 METTL24Q5JXM2 366 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 TEPSINQ96N21 525 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 WRNIP1Q96S55 665 aa14.55□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 TLR2O60603 784 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 HOXD10P28358 340 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 FAM83AQ86UY5 434 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 MRS2Q9HD23 443 aa14.54□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 PPIL2Q13356 520 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.53□□□□□ -0.08
CMTM1-211ENST00000528484 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.52□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 BTBD19C9JJ37 291 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 IRF6O14896 467 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 CACNB3P54284 484 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 PPATQ06203 517 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 RAET1EQ8TD07 263 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 SUCLG2Q96I99 432 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 MRIQ9BWK5 157 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 CEP290O15078 2479 aa14.51□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 PDE8BO95263 885 aa14.5□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 CAP1Q01518 475 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 CCDC184Q52MB2 194 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 DPF3Q92784 378 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 AK9Q5TCS8 1911 aa14.49□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 KIF16BQ96L93 1317 aa14.48□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 SZT2Q5T011 3432 aa14.48□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CMTM1-211ENST00000528484 PSMC4P43686 418 aa14.48□□□□□ -0.09
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