RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525524.1

EDRF1-211, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 462 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-211ENST00000525524 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.57□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 KLHDC7BQ96G42 594 aa6.57□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 WDR64B1ANS9 1081 aa6.56□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 OCLNQ16625 522 aa6.56□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 ELP3Q9H9T3 547 aa6.56□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 PIM2Q9P1W9 311 aa6.56□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.56□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.56□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 PRR19A6NJB7 356 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 CES1P23141 567 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 NLRP12P59046 1061 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 MLECQ14165 292 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 CEP120Q8N960 986 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.55□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 GOLGA3Q08378 1498 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 TNFRSF10BO14763 440 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 PREPP48147 710 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.54□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 ATP10BO94823 1461 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 RICTORQ6R327 1708 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 MEGF11A6BM72 1044 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 ADAM11O75078 769 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 PAOXQ6QHF9 649 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 STRCQ7RTU9 1775 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 NEO1Q92859 1461 aa6.53□□□□□ -1.36
EDRF1-211ENST00000525524 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 USP11P51784 963 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 JAG1P78504 1218 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FBXL18Q96ME1 805 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ZMYND15Q9H091 742 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.52□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 IKBKEQ14164 716 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FBXL6Q8N531 539 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 STK32AQ8WU08 396 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ASIC4Q96FT7 647 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FANCAO15360 1455 aa6.51□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 TM4SF5O14894 197 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ATG7O95352 703 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 NFKBIBQ15653 356 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 C8orf34Q49A92 452 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 XKR5Q6UX68 686 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.5□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ADAMTS4O75173 837 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FOSL1P15407 271 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FAM26DQ5JW98 314 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 BSNDQ8WZ55 320 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 USP26Q9BXU7 913 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 AKNAQ7Z591 1439 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.49□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 EDN3P14138 238 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SGO2Q562F6 1265 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 EDEM1Q92611 657 aa6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
EDRF1-211ENST00000525524 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms