RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476070.1

CERKL-211, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 4

Gene CERKL, Length 572 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-211ENST00000476070 CDAN1Q8IWY9 1227 aa16.06■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 MMP14P50281 582 aa16.05■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 NOGQ13253 232 aa16.05■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 PRKG1Q13976 671 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 DEFB129Q9H1M3 183 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 COPRSQ9NQ92 184 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 OTOFQ9HC10 1997 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa16.04■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 CIAO1O76071 339 aa16.03■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 RLBP1P12271 317 aa16.03■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 ADORA1P30542 326 aa16.03■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 FKBP1BP68106 108 aa16.03■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 MTX1Q13505 466 aa16.03■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 LPIN2Q92539 896 aa16.03■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 CRKP46108 304 aa16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 VPS37DQ86XT2 251 aa16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 CSRNP1Q96S65 589 aa16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 VEZTQ9HBM0 779 aa16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.02■□□□□ 0.16
CERKL-211ENST00000476070 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 SRGAP3O43295 1099 aa16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 ATP2B3Q16720 1220 aa16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CCDC102AQ96A19 550 aa16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 GNAI3P08754 354 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 SLC5A1P13866 664 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 PHKA1P46020 1223 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CACNB3P54284 484 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 RASA3Q14644 834 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 LDLRAD1Q5T700 205 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TEPSINQ96N21 525 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 RNF186Q9NXI6 227 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 FBXO3Q9UK99 471 aa16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TFCP2Q12800 502 aa15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 C1orf115Q9H7X2 142 aa15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 LAMB1P07942 1786 aa15.99■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CLCN6P51797 869 aa15.98■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TIMM10P62072 90 aa15.98■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TMEM39BQ9GZU3 492 aa15.98■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CEP126Q9P2H0 1117 aa15.98■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 MYO1BO43795 1136 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 GNAI2P04899 355 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 PRDX5P30044 214 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 MAP3K11Q16584 847 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.97■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 A0A1B0GUL7 405 aa15.96■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 USP2O75604 605 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 TRPA1O75762 1119 aa15.96■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 NF2P35240 595 aa15.96■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CCDC102BQ68D86 513 aa15.96■□□□□ 0.15
CERKL-211ENST00000476070 CA12O43570 354 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 GJA5P36382 358 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 RASGRF1Q13972 1273 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 LHX8Q68G74 356 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 PANK1Q8TE04 598 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 TEKT1Q969V4 418 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 SPRYD7Q5W111 196 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 PI16Q6UXB8 463 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 XAGE2Q96GT9 111 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 SAGE1Q9NXZ1 904 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.94■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.93■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.93■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 MRIQ9BWK5 157 aa15.93■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.93■□□□□ 0.14
CERKL-211ENST00000476070 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms