RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474324.1

HOXB-AS3-207, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 421 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PSMC4P43686 418 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 IRF6O14896 467 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TAF5LO75529 589 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CSF1RP07333 972 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CETPP11597 493 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RNF208Q9H0X6 261 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CPA4Q9UI42 421 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 Q7L0L9 218 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SPEF2Q9C093 1822 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 KCNJ4P48050 445 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CASP7P55210 303 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TNFAIP1Q13829 316 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GPR153Q6NV75 609 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 KSR2Q6VAB6 950 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ERO1BQ86YB8 467 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DEFB123Q8N688 67 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RAET1EQ8TD07 263 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CSADQ9Y600 493 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 EVI5O60447 810 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SGPL1O95470 568 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GDF15Q99988 308 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SNAPC2Q13487 334 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MRS2Q9HD23 443 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 EYSQ5T1H1 3165 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FAM205AQ6ZU69 1335 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MYPNQ86TC9 1320 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXB-AS3-207ENST00000474324 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 HOXD10P28358 340 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BMP8BP34820 402 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PRKCZQ05513 592 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MOGSQ13724 837 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GRIK5Q16478 980 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 RUNDC1Q96C34 613 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GABRQQ9UN88 632 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PPIL2Q13356 520 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PDHXO00330 501 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 UBXN2AP68543 259 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GCKRQ14397 625 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TSPYL6Q8N831 410 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 WRNIP1Q96S55 665 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MYH3P11055 1940 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BCRP11274 1271 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CRKP46108 304 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CACNB3P54284 484 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 G2E3Q7L622 706 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.86□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 TNNI2P48788 182 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 BCAMP50895 628 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PPATQ06203 517 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 DEFB118Q96PH6 123 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 IFT57Q9NWB7 429 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.85□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ADCY3O60266 1144 aa14.84□□□□□ -0.03
HOXB-AS3-207ENST00000474324 ELNP15502 786 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms