RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 SRGAP3O43295 1099 aa23.1■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 TM4SF4P48230 202 aa23.1■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 SIL1Q9H173 461 aa23.1■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 GRIK5Q16478 980 aa23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 VPS37DQ86XT2 251 aa23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 COPRSQ9NQ92 184 aa23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 COG6Q9Y2V7 657 aa23.09■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 PDE8BO95263 885 aa23.08■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 RASA3Q14644 834 aa23.08■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.08■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.08■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SYP-205ENST00000472598 CIAO1O76071 339 aa23.07■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 BCAMP50895 628 aa23.07■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SPRYD7Q5W111 196 aa23.07■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 MS4A1P11836 297 aa23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 FGFR2P21802 821 aa23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 FBXO3Q9UK99 471 aa23.06■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 CRKP46108 304 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 POLA2Q14181 598 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.05■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 RGS19P49795 217 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 PDE3AQ14432 1141 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 MAP3K11Q16584 847 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 ATP8B2P98198 1209 aa23.03■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SREBF2Q12772 1141 aa23.03■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.03■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 SSH3Q8TE77 659 aa23.03■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 GPR25O00155 361 aa23.02■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 CEP85Q6P2H3 762 aa23.02■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 WNK4Q96J92 1243 aa23.02■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.02■■□□□ 1.28
SYP-205ENST00000472598 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.01■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.01■■□□□ 1.27
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SYP-205ENST00000472598 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 GJA5P36382 358 aa22.99■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 CACNB3P54284 484 aa22.99■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 SOX10P56693 466 aa22.99■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 TEPSINQ96N21 525 aa22.99■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.99■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.99■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 TFCP2Q12800 502 aa22.98■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 TNFAIP1Q13829 316 aa22.98■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 IFNL1Q8IU54 200 aa22.98■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.98■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 LPIN2Q92539 896 aa22.98■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 ATP2B3Q16720 1220 aa22.97■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.97■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 ELP3Q9H9T3 547 aa22.97■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 SLC5A1P13866 664 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 TEKT1Q969V4 418 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.96■■□□□ 1.27
SYP-205ENST00000472598 FKTNO75072 461 aa22.95■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 ADORA1P30542 326 aa22.95■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 INHBEP58166 350 aa22.95■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 ALDH1A1P00352 501 aa22.94■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 TNNI2P48788 182 aa22.94■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.94■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 UNCXA6NJT0 531 aa22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 TIMM10P62072 90 aa22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 OPTNQ96CV9 577 aa22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 PTPN18Q99952 460 aa22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.93■■□□□ 1.26
SYP-205ENST00000472598 A0A1B0GUL7 405 aa22.92■■□□□ 1.26
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