RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428946.5

LRRC23-204, Transcript of leucine rich repeat containing 23, humanhuman

TSL 3

Gene LRRC23, Length 969 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23-204ENST00000428946 OTOFQ9HC10 1997 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 BCAMP50895 628 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 SRGAP3O43295 1099 aa22.73■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.73■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.73■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 CRKP46108 304 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 RASA3Q14644 834 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 PANK1Q8TE04 598 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 COPRSQ9NQ92 184 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.72■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 CIAO1O76071 339 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 FGFR2P21802 821 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 MTX1Q13505 466 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.71■■□□□ 1.23
LRRC23-204ENST00000428946 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.7■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.7■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 FBXO3Q9UK99 471 aa22.7■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 TBC1D8O95759 1140 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.69■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.68■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 SLC5A1P13866 664 aa22.68■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 SPRYD7Q5W111 196 aa22.68■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 LPIN2Q92539 896 aa22.68■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 CACNB3P54284 484 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 MAP3K11Q16584 847 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 LAMB1P07942 1786 aa22.67■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 TM4SF4P48230 202 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 SREBF2Q12772 1141 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 TNFAIP1Q13829 316 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.66■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 ATP2B3Q16720 1220 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 WNK4Q96J92 1243 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC23-204ENST00000428946 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ATP8B2P98198 1209 aa22.64■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TEKT1Q969V4 418 aa22.64■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TEPSINQ96N21 525 aa22.64■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 MS4A1P11836 297 aa22.63■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TFCP2Q12800 502 aa22.63■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.63■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 GJA5P36382 358 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TIMM10P62072 90 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 COG6Q9Y2V7 657 aa22.62■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ADORA1P30542 326 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 POLA2Q14181 598 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ELP3Q9H9T3 547 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 MAST3O60307 1309 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 GPR25O00155 361 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 PHKA1P46020 1223 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TNNI2P48788 182 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 SSH3Q8TE77 659 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.6■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.59■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 IFNL1Q8IU54 200 aa22.59■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 OPTNQ96CV9 577 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 AK9Q5TCS8 1911 aa22.58■■□□□ 1.21
LRRC23-204ENST00000428946 A0A1B0GUL7 405 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 PRDX5P30044 214 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 CEP85Q6P2H3 762 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.57■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 VGLL4Q14135 290 aa22.56■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 CCDC102BQ68D86 513 aa22.56■■□□□ 1.2
LRRC23-204ENST00000428946 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
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