RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF208Q9H0X6 261 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SRRDQ9UH36 339 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH3P11055 1940 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SSC5DA1L4H1 1573 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 IL1R1P14778 569 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 VGLL4Q14135 290 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF15Q66K64 600 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MBIPQ9NS73 344 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 IFT57Q9NWB7 429 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa10.04□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL5P13501 91 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMC4P43686 418 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 FCGRTP55899 365 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC146Q8IYE0 955 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MYPNQ86TC9 1320 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SPEF2Q9C093 1822 aa10.03□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR29P0C7W0 189 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 PPIL2Q13356 520 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MTFR1Q15390 333 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD14BQ5SR56 506 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CERS5Q8N5B7 392 aa10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 NEURL1BA8MQ27 555 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TCP10L2B9ZVM9 353 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD19C9JJ37 291 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 H7C1W4 665 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 SGPL1O95470 568 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TFRCP02786 760 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 KLRK1P26718 216 aa10.01□□□□□ -0.81
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PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf99Q6UX52 265 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.01□□□□□ -0.81
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PGGT1B-201ENST00000296642 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA4Q96DD7 197 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 WRNIP1Q96S55 665 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 PRO3102Q9H379 93 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM205AQ6ZU69 1335 aa10.01□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV5-2P06315 115 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CSF1RP07333 972 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPP22059 807 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC57Q2TAC2 916 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM83AQ86UY5 434 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF341Q9BYN7 854 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM39BQ9GZU3 492 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CNNM1Q9NRU3 951 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MAST3O60307 1309 aa10□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 PDHXO00330 501 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 IRF6O14896 467 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF5LO75529 589 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF853P0CG23 659 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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PGGT1B-201ENST00000296642 CRKP46108 304 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CAP1Q01518 475 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 GCKRQ14397 625 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TEKT1Q969V4 418 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 TEPSINQ96N21 525 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CPA4Q9UI42 421 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP290O15078 2479 aa9.99□□□□□ -0.81
PGGT1B-201ENST00000296642 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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