RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 CFAP58Q5T655 872 aa20.29■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 TCHPQ9BT92 498 aa20.29■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 KRT79Q5XKE5 535 aa20.29■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 ATP6V1AP38606 617 aa20.29■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 IMPG2Q9BZV3 1241 aa20.29■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 RUFY3Q7L099 469 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 A0A1B0GVL5 298 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 VAV2P52735 878 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 HDXQ7Z353 690 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 RTL9Q8NET4 1388 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 PPARDQ03181 441 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 GNAQP50148 359 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 CEP83Q9Y592 693 aa20.28■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 TUBB4AP04350 444 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 EVCP57679 992 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 OGFRQ9NZT2 677 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 CPA1P15085 419 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-201ENST00000264828 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TNNC1P63316 161 aa20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TFCP2Q12800 502 aa20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SETDB1Q15047 1291 aa20.26■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SMC5Q8IY18 1101 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SEC24BO95487 1268 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF174Q15697 407 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CFAP157Q5JU67 520 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TXNDC16Q9P2K2 825 aa20.25■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CEP85Q6P2H3 762 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 JAG2Q9Y219 1238 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 NAA25Q14CX7 972 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 KSR2Q6VAB6 950 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 RBSNQ9H1K0 784 aa20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TRIM7Q9C029 511 aa20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 NPATQ14207 1427 aa20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CALML3P27482 149 aa20.23■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 C8orf37Q96NL8 207 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SP4Q02446 784 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CALCOCO2Q13137 446 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 GBP6Q6ZN66 633 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 RLBP1P12271 317 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 KRT5P13647 590 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CNGA4Q8IV77 575 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 VPS16Q9H269 839 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 BRAPQ7Z569 592 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 ALDH1L1O75891 902 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 MYL5Q02045 173 aa20.22■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 STIM2Q9P246 746 aa20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 ZWINTO95229 277 aa20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 SETDB2Q96T68 719 aa20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
COL5A3-201ENST00000264828 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms