RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	FAM53B	Q14153	422 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	OSTC	Q9NRP0	149 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	YPEL1	O60688	119 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	WDR38	Q5JTN6	314 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ASPDH	A6ND91	283 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	CD300C	Q08708	224 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	NDUFB4	O95168	129 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	EPPIN	O95925	133 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ZP4	Q12836	540 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	MDP1	Q86V88	176 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	VWC2L	B2RUY7	222 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PRRG2	O14669	202 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	UCP2	P55851	309 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	NHS	Q6T4R5	1651 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		J3QW42	95 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	CDC42EP2	O14613	210 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SIVA1	O15304	175 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PLPP1	O14494	284 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	NEU1	Q99519	415 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	EPDR1	Q9UM22	224 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	RDH5	Q92781	318 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	DAPP1	Q9UN19	280 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PDE6H	Q13956	83 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	MISP3	Q96FF7	219 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	LRRC61	Q9BV99	259 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		A8MWP6	167 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		H3BP45	60 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	FGF16	O43320	207 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SPINK4	O60575	86 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ANOS1	P23352	680 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF714	Q96N38	554 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	METTL26	Q96S19	204 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		A0A0A6YYD5	115 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		F8VVB4	439 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		F8VWA3	439 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	LINC01565	O15544	149 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	LDB3	O75112	727 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PI3	P19957	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	RUNX1	Q01196	453 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TBR1	Q16650	682 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM86B	Q8N661	226 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459		C9JCJ5	164 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV4-34	P06331	123 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	C8orf88	P0DMB2	117 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	GUCA2A	Q02747	115 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	FGF21	Q9NSA1	209 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	NGF	P01138	241 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ABHD3	Q8WU67	409 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	ERG28	Q9UKR5	140 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PRSS2	P07478	247 aa		6.22	□□□□□ -1.41
MDM4-215	ENST00000614459	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		6.22	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms