RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 OOSP1A8MZH6 123 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TCAPO15273 167 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CD8AP01732 235 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 P2RY4P51582 365 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MGPP08493 103 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 LTBRP36941 435 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 EGR4Q05215 589 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 HIST3H3Q16695 136 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 NRTNQ99748 197 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SCTP09683 121 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MESP2Q0VG99 397 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TGIF1Q15583 401 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C19orf54Q5BKX5 351 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MARVELD3Q96A59 401 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TCF19Q9Y242 345 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 NUP205Q92621 2012 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TIMP3P35625 211 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 IGSF11Q5DX21 431 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ZIC4Q8N9L1 334 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01549A6NIU2 74 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ZIC3O60481 467 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 PRNTQ86SH4 94 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 RNF5Q99942 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CD99P14209 185 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CAMPP49913 170 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf172C9J069 976 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM250H0YL14 139 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TCTAP57738 103 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TWIST1Q15672 202 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 NUP37Q8NFH4 326 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF488Q96MN9 340 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 IL17BQ9UHF5 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DLX6P56179 175 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PRD5 423 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PRF3 423 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1W2PRM7 423 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MYOD1P15172 320 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FXYD3Q14802 87 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TCF24Q7RTU0 167 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FAM168AQ92567 244 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 PHOX2AO14813 284 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 YPEL1O60688 119 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MOSP00540 346 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DUX5Q96PT3 197 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 YPEL2Q96QA6 119 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 SNURFLB1AK76 121 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 LHX2P50458 406 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2V2Q15819 145 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 FMC1Q96HJ9 113 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 C17orf100A8MU93 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 CECR9P0C854 216 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 RND2P52198 227 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 ANOS1P23352 680 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-208ENST00000550358 LEPP41159 167 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms