RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533232.5

SOX9-AS1-212, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SOX9-AS1, Length 1,739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CLN8Q9UBY8 286 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MIOXQ9UGB7 285 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PSG11Q9UQ72 335 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-212ENST00000533232 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.53□□□□□ -1.36
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 A0A1W2PPV4 95 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SRRM5B3KS81 715 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 F6UZH7 168 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 H7BYZ3 331 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 WNT9BO14905 357 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BKO60814 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TRGC2P03986 189 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BJP06899 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CD99P14209 185 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BOP23527 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CD1BP29016 333 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BBP33778 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BDP58876 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SELENOVP59797 346 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BCP62807 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 Q3ZCU0 254 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 S100PBPQ96BU1 408 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PFDN5Q99471 154 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SSX3Q99909 188 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GNG12Q9UBI6 72 aa6.52□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PPP5D1E7EU14 171 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 C15orf65H3BRN8 121 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 YIF1AO95070 293 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 AGFG2O95081 481 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PMP22Q01453 160 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 RAB31Q13636 194 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MORN2Q502X0 79 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ACSM6Q6P461 480 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 VWA1Q6PCB0 445 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SSX7Q7RTT5 188 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR4F5Q8NH21 305 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CORO2AQ92828 525 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 RAB24Q969Q5 203 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OR4F4Q96R69 305 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 S1PR3Q99500 378 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SLC25A22Q9H936 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CHODLQ9H9P2 273 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 DNAJC13O75165 2243 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TECTAO75443 2155 aa6.51□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 F2RL2O00254 374 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 FCGR3BO75015 233 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 MT-CO2P00403 227 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IFNA10P01566 189 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 IGHV3-13P01766 116 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 CRYAAP02489 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TRGC1P0CF51 173 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 SSTR5P35346 364 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 OPRK1P41145 380 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 GALR1P47211 349 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 TMPRSS3P57727 454 aa6.5□□□□□ -1.37
SOX9-AS1-212ENST00000533232 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms