RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PQM1 296 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 SYT13Q7L8C5 426 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 C5orf30Q96GV9 206 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 DEPPQ9NTK1 212 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.98□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 CA6P23280 308 aa14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 BTF3L4Q96K17 158 aa14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 NDUFB8O95169 186 aa14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.97□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 IGHEP01854 428 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 SLC35B1P78383 322 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 CCL7P80098 99 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 PSG7Q13046 419 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 LRRC30A6NM36 301 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 FCN1O00602 326 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 LTBRP36941 435 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 SSR4P51571 173 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 SRYQ05066 204 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 VHLLQ6RSH7 139 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 VASH2Q86V25 355 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 Q8N7P7 452 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.96□□□□□ -0.01
PREB-208ENST00000468045 C17orf98A8MV24 154 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 RRHO14718 337 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TMPRSS2O15393 492 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TIMP3P35625 211 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 PTTG1IPP53801 180 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 MAJINQ3KP22 176 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SAXO1Q8IYX7 474 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ATOH7Q8N100 152 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.96□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 CBY3A6NI87 242 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 K7EN84 100 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 PAFAH1B2P68402 229 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 LRFN3Q9BTN0 628 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 OR2D2Q9H210 308 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 PDE6DO43924 150 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TFF1P04155 84 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 BRWD1-AS2P59051 145 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SLC35E1Q96K37 410 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.95□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 A0A1W2PPV4 95 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 CCL25O15444 150 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SELENOTP62341 195 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SPATA45Q537H7 98 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 Q8N976 141 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SNURFLB1AK76 121 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 DIRC3C9JPN6 131 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SYNGR4O95473 234 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 CD99P14209 185 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 Q6P435 159 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 C20orf202A1L168 122 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 OR2H2O95918 312 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 PMCHP20382 165 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 GNB4Q9HAV0 340 aa14.94□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 CLDN14O95500 239 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 RCHY1Q96PM5 261 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ATP6V1FQ16864 119 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 RNF24Q9Y225 148 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 GJE1A6NN92 205 aa14.92□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 COX6A1P12074 109 aa14.92□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.92□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 OR5G3P0C626 314 aa14.92□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.92□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.92□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 RANP62826 216 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 MIC13Q5XKP0 118 aa14.91□□□□□ -0.02
PREB-208ENST00000468045 Q6ZN92 141 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms