RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5B3Q8NH48 314 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 DCUN1D4Q92564 292 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FGGYQ96C11 551 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KCTD7Q96MP8 289 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 CLCC1Q96S66 551 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR51J1Q9H342 316 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KCNK15Q9H427 330 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 DHDHQ9UQ10 334 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MED31Q9Y3C7 131 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.13□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A087WUU8 490 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 GAGE12BA1L429 117 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM89A2RUT3 159 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 IFNL4K9M1U5 179 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFRSF11BO00300 401 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PLA2G10O15496 165 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FGF16O43320 207 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 LYRM1O43325 122 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 LMX1BO60663 402 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC16A7O60669 478 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FCN3O75636 299 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MPZL1O95297 269 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PSG2P11465 335 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 GABRA5P31644 462 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TGFBR1P36897 503 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF84P51523 738 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TCL1AP56279 114 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 SMIM11AP58511 58 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 RHOBP62745 196 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FABP5Q01469 135 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TNP2Q05952 138 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FHL1Q13642 323 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KIR2DS1Q14954 304 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 UBE2V2Q15819 145 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF525Q8N782 197 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4A16Q8NH70 328 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PTX4Q96A99 478 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR51E2Q9H255 320 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 KIAA1456Q9P272 454 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ETV7Q9Y603 341 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.12□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A087WX48 190 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 A0A1W2PRD5 423 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM189A5PLL7 270 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 C11orf98E9PRG8 122 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 DCTN6O00399 190 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 CDC42EP2O14613 210 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 DIRAS1O95057 198 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 IGHMP01871 453 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PGA4P0DJD7 388 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PGA3P0DJD8 388 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM225BP0DP42 221 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PSG1P11464 419 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 PGAM2P15259 253 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 HTR1DP28221 377 aa6.11□□□□□ -1.43
RPUSD3-212ENST00000466141 CDAP32320 146 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms