RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 PLAUP00749 431 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 CEACAM1P13688 526 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 COX6B1P14854 86 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PAFAH1B2P68402 229 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNRF1Q8ND25 227 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 OR5AU1Q8NGC0 362 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM191AQ9H0A3 160 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM27E3Q08E93 113 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TCF19Q9Y242 345 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF735P0CB33 412 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PQLC2Q6ZP29 291 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC15Q8N387 334 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TP53RKQ96S44 253 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 DOCK6Q96HP0 2047 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC37A2A6NM11 1700 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 J3QR89 54 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 APCSP02743 223 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 MELTFP08582 738 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 KLRB1Q12918 225 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM97Q5BJF2 176 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM186Q96B77 213 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 MEGF10Q96KG7 1140 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GTI1 187 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 B9A039 149 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4C13Q8NGP0 309 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVH48-1M5A8F1 160 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF137PP52743 207 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PITPNC1Q9UKF7 332 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 RHBDL1O75783 438 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 KBTBD11O94819 623 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 DYNLRB2Q8TF09 96 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 GFRA1P56159 465 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM8Q96KF7 97 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 NCOR1O75376 2440 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 MFAP2P55001 183 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 IFITM2Q01629 132 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 LINC01560Q8TB33 94 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB24Q969Q5 203 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 GUCD1Q96NT3 240 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 TLNRD1Q9H1K6 362 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 LYPD3O95274 346 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ID1P41134 155 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 WDFY1Q8IWB7 410 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 RTN4RQ9BZR6 473 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 CD40P25942 277 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 ACP7Q6ZNF0 438 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 C9orf172C9J069 976 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 PF4V1P10720 104 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 LHFPL5Q8TAF8 219 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC7AQ9BXN2 247 aa18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRJ-201ENST00000418331 KLK2P20151 261 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 SIGLEC5O15389 551 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CD8AP01732 235 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM209AQ5JX71 171 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 SH3BGRL3Q9H299 93 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 ID4P47928 161 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 COMPP49747 757 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MWL6 223 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 LIPFP07098 398 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf77C9JDV5 145 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 MDKP21741 143 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 CFHR1Q03591 330 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 PGPA6NDG6 321 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS25Q9BRG1 176 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 NPIPB7O75200 414 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 MGPP08493 103 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 SCGB1C2P0DMR2 95 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 ABHD17AQ96GS6 310 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 SCN5AQ14524 2016 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 WDYHV1Q96HA8 205 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms