RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 NECAP1Q8NC96 275 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 NEK7Q8TDX7 302 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 GPR146Q96CH1 333 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ATG101Q9BSB4 218 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 GPR35Q9HC97 309 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM160Q9NX00 188 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 KNTC1P50748 2209 aa6.07□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRBP23467 1997 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 A8MXE2 369 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MPDU1O75352 247 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MT-ND6P03923 174 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 IL3RAP26951 378 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 BRS3P32247 399 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 SSX7Q7RTT5 188 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 CACNG5Q9UF02 275 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 IL17BQ9UHF5 180 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RFNGQ9Y644 331 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF292O60281 2723 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 H3BP45 60 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 CBR3O75828 277 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV1D-12P01611 117 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 GZMHP20718 246 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 PTGDSP41222 190 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 FOXL2P58012 376 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 DTX1Q86Y01 620 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 PSMF1Q92530 271 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR4C12Q96R67 309 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RASL10BQ96S79 203 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 DIRC2Q96SL1 478 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RNF2Q99496 336 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ABI3Q9P2A4 366 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ARID1AO14497 2285 aa6.06□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf202A1L168 122 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf94C9JXX5 98 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB1BP1O14713 200 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 CD55P08174 381 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 KITLGP21583 273 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 SSR4P51571 173 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 GNB2P62879 340 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 Q0VG73 95 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 FAM78BQ5VT40 261 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 WDR73Q6P4I2 378 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 LINC01551Q86U37 167 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 PIGCQ92535 297 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 DYRK2Q92630 601 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 JKAMPQ9P055 326 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.05□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 C5orf63A6NC05 138 aa6.04□□□□□ -1.44
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF814B7Z6K7 855 aa6.04□□□□□ -1.44
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