RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 TPPPO94811 219 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5H8P0DN80 308 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 CNTFRP26992 372 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 FCGR2CP31995 323 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 MC5RP33032 325 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 CDK10Q15131 360 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 OVCH2Q7RTZ1 564 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 MFSD4AQ8N468 514 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 H7C2Y5 167 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 SULT1C2O00338 296 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 PPYP01298 95 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV1-16P04430 117 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 AADACP22760 399 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 RFX2P48378 723 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 MMDQ15546 238 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 NPBQ8NG41 125 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 GIMAP1Q8WWP7 306 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 KLK11Q9UBX7 282 aa8.96□□□□□ -0.97
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC01548A6NM66 108 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00473A8K010 186 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 NDUFA3O95167 84 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 IGHG2P01859 326 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PMP2P02689 132 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HLA-DMAP28067 261 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HRH1P35367 487 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TAS2R46P59540 309 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DYRK1AQ13627 763 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PDPNQ86YL7 162 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 OR52I2Q8NH67 350 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DDB2Q92466 427 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 EHFQ9NZC4 300 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 NBR2O15453 112 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PEX14O75381 377 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC22A5O76082 557 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 APOA2P02652 100 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TNFSF8P32971 234 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RCVRNP35243 200 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 THBS3P49746 956 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CCDC190Q86UF4 302 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 S100ZQ8WXG8 99 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF5Q99942 180 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RBBP9O75884 186 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 S100A5P33763 92 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ETV6P41212 452 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FXYD4P59646 89 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DGCR2P98153 550 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF846Q147U1 533 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FCAMRQ8WWV6 532 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 GABARAPH6UMI1 98 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RRHO14718 337 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CTDSPLO15194 276 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 HLA-DRB1P01911 266 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 CD28P10747 220 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCL3L3-201ENST00000612839 IL18Q14116 193 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms