RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602708.1

DENND4C-208, Transcript of DENN domain containing 4C, humanhuman

TSL 4

Gene DENND4C, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4C-208ENST00000602708 SCN9AQ15858 1988 aa-0.28□□□□□ -2.45
DENND4C-208ENST00000602708 NUMA1Q14980 2115 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MYCBP2O75592 4640 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CASC3O15234 703 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CRYGCP07315 174 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 STAG3L3P0CL85 134 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 GADD45AP24522 165 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CD79BP40259 229 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 DAPP51397 102 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 XRCC4Q13426 336 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TRAM1Q15629 374 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 DOLPP1Q86YN1 238 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR2D3Q8NGH3 330 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TAMM41Q96BW9 452 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 ABHD14BQ96IU4 210 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CIB1Q99828 191 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MED18Q9BUE0 208 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 REG4Q9BYZ8 158 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 HAUS4Q9H6D7 363 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 UBQLN4Q9NRR5 601 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 LHFPL6Q9Y693 200 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 ASXL3Q9C0F0 2248 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa-0.29□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 A0A0D9SEW6 157 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 A0A1W2PPV4 95 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 HMSDA8MTL9 139 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 STK16O75716 305 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 BCAP31P51572 246 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 EMP1P54849 157 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 AQP4P55087 323 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 GTF2BQ00403 316 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 RUNX1Q01196 453 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PID1Q7Z2X4 250 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 C12orf29Q8N999 325 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR51T1Q8NGJ9 327 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR4A15Q8NGL6 344 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PGLYRP3Q96LB9 341 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TMEM222Q9H0R3 208 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MED28Q9H204 178 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FBXO44Q9H4M3 255 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CHRAC1Q9NRG0 131 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 SLC2A9Q9NRM0 540 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 DSCAML1Q8TD84 2053 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 VWFP04275 2813 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PCDH15Q96QU1 1955 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.3□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MGAT4DA6NG13 374 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR51F1A6NGY5 319 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 H0YIV9 168 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FABP7O15540 132 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CRXO43186 299 aaPredicted RBP-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 SC5DO75845 299 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CDK14O94921 469 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PSMG1O95456 288 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 GIMD1P0DJR0 217 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR13C7P0DN81 318 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CRATP43155 626 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 ETV1P50549 477 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 AQP5P55064 265 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 SNAP25P60880 206 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MIAQ16674 131 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TEX36Q5VZQ5 186 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 FAM173BQ6P4H8 233 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 GRINAQ7Z429 371 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 ZNF565Q8N9K5 539 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR13C9Q8NGT0 318 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 OR5P2Q8WZ92 322 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 COPS4Q9BT78 406 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 TRABDQ9H4I3 376 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 DMAC2Q9NW81 257 aa-0.31□□□□□ -2.46
DENND4C-208ENST00000602708 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-0.31□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms