RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593072.5

EFTUD2-225, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 5

Gene EFTUD2, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-225	ENST00000593072	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MFSD4A	Q8N468	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CCDC107	Q8WV48	283 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	S100Z	Q8WXG8	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RITA1	Q96K30	269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		V9GYH0	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HERC2	O95714	4834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A1W2PN81	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SLC31A2	O15432	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	XRCC3	O43542	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PTHLH	P12272	177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IL3RA	P26951	378 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CNTFR	P26992	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CHRNA7	P36544	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TALDO1	P37837	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ETV6	P41212	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MMD	Q15546	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF79	Q15937	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	DDB2	Q92466	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		A0A0A6YYH2	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072		A6NJ64	397 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	MFNG	O00587	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HSPA12A	O43301	675 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	PDCD6	O75340	191 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SCGN	O76038	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	BRI3	O95415	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GNB3	P16520	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	GZMH	P20718	246 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF45	Q02386	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	IL18	Q14116	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-225	ENST00000593072	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms