RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 PARLQ9H300 379 aa18.38■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa18.37■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 MIC13Q5XKP0 118 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.37■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 GPHA2Q96T91 129 aa18.37■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 FHL5Q5TD97 284 aa18.37■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 KCNMB1Q16558 191 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 ITLN1Q8WWA0 313 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 GUCD1Q96NT3 240 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 MYO16Q9Y6X6 1858 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 LOXL3P58215 753 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRM-211ENST00000580170 PMS2CLQ68D20 193 aa18.35■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.34■□□□□ 0.53
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PTPRM-211ENST00000580170 SSTR5P35346 364 aa18.33■□□□□ 0.52
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM78Q5T7P6 136 aa18.32■□□□□ 0.52
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PTPRM-211ENST00000580170 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.32■□□□□ 0.52
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PTPRM-211ENST00000580170 SMIM10Q96HG1 83 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 SRXN1Q9BYN0 137 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 ZG16O60844 167 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 SELENOTP62341 195 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 OR8G5Q8NG78 346 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 GRIFINA4D1Z8 144 aa18.31■□□□□ 0.52
PTPRM-211ENST00000580170 TNFRSF9Q07011 255 aa18.31■□□□□ 0.52
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