RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	FGF7	P21781	194 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	COL10A1	Q03692	680 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	VWC2	Q2TAL6	325 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RRN3-205	ENST00000563559	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PRR33	A8MZF0	331 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-33	P01593	117 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1-33	P01594	117 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TRGC2	P03986	189 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CECR9	P0C854	216 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CD81	P60033	236 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	GNB2	P62879	340 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	ACSM6	Q6P461	480 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZR03	302 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	OR5H1	A6NKK0	313 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	ZG16	O60844	167 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	KBTBD11	O94819	623 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CCL11	P51671	97 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	BEND4	Q6ZU67	534 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	GGACT	Q9BVM4	153 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GWJ7	208 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R2P9	O14990	202 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SOX15	O60248	233 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV1-44	P01699	117 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CD55	P08174	381 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SSTR5	P35346	364 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FABP6	P51161	128 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	VWA1	Q6PCB0	445 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	MARCH11	A6NNE9	402 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00587	B1AMM8	73 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	GZMH	P20718	246 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559		Q3ZCU0	254 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	MSL2	Q9HCI7	577 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PSG11	Q9UQ72	335 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A22	Q9H936	323 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00473	A8K010	186 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	NKX2-8	O15522	239 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PRDX2	P32119	198 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	P2RY6	Q15077	328 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	C15orf65	H3BRN8	121 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	ADIRF	Q15847	76 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	AARD	Q4LEZ3	155 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC29	Q8WV35	223 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IFITM10	A6NMD0	228 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	AHRR	A9YTQ3	701 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	ST8SIA5	O15466	376 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	GPR12	P47775	334 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	BSX	Q3C1V8	233 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RFESD	Q8TAC1	157 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	R3HDM4	Q96D70	268 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	METRN	Q9UJH8	293 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	JPT1	Q9UK76	154 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FZR1	Q9UM11	496 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV2-70	P01814	119 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FOXF2	Q12947	444 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CD177	Q8N6Q3	437 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RAB24	Q969Q5	203 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SMCO3	A2RU48	225 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	HPRT1	P00492	218 aa		15.34	■□□□□ 0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TRGC1	P0CF51	173 aa		15.34	■□□□□ 0.05

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