RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560549.5

TMOD3-207, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMOD3, Length 1,474 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-207ENST00000560549 MTCH1Q9NZJ7 389 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD3-207ENST00000560549 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF175Q9Y473 711 aa3.6□□□□□ -1.83
TMOD3-207ENST00000560549 MED13Q9UHV7 2174 aa3.59□□□□□ -1.83
TMOD3-207ENST00000560549 FLNCQ14315 2725 aa3.59□□□□□ -1.83
TMOD3-207ENST00000560549 ATMQ13315 3056 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ITPR2Q14571 2701 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 LINC00862A6NCI5 91 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 RFPL4AA6NLU0 287 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CD300LBA8K4G0 201 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 MPTX1A8MV57 137 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 LEUTXA8MZ59 168 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF732B4DXR9 585 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 E5RGE8 158 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ARPC5O15511 151 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CA11O75493 328 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 LYZL6O75951 148 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 SFT2D2O95562 160 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CD8AP01732 235 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 IFNA6P05013 189 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 FCGR3AP08637 254 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF24P17028 368 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 PRKACAP17612 351 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 HLA-GP17693 338 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 TBPP20226 339 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 IL32P24001 234 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ARR3P36575 388 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CBX5P45973 191 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 GPM6AP51674 278 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 RBM11P57052 281 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 GABRA6Q16445 453 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 Q3ZCU0 254 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 C6orf183Q5T699 404 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 OR2T2Q6IF00 324 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 WDR86Q86TI4 376 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF329Q86UD4 541 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 OSR2Q8N2R0 312 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 OR5AU1Q8NGC0 362 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CXorf58Q96LI9 332 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 S100A13Q99584 98 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 RNF126Q9BV68 326 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 PPA2Q9H2U2 334 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 UBTD1Q9HAC8 227 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 EHFQ9NZC4 300 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 MIOXQ9UGB7 285 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 NSG2Q9Y328 171 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 MGAQ8IWI9 3026 aa3.59□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 DOCK10Q96BY6 2186 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 LRRK2Q5S007 2527 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 TRAV17A0A0B4J275 112 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 HMSDA8MTL9 139 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 SERPINE3A8MV23 424 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 H0YL77 283 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ABCD4O14678 606 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 NBR2O15453 112 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 PDCD6O75340 191 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ADAP1O75689 374 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CGAP01215 116 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 OR5H8P0DN80 308 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 SLC25A4P12235 298 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CA6P23280 308 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 S100A1P23297 94 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 MPV17P39210 176 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 IL15RAQ13261 267 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ACTBL2Q562R1 376 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 ELP2Q6IA86 826 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 RTL6Q6ICC9 239 aa3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
TMOD3-207ENST00000560549 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms