RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 DEFB113Q30KQ7 82 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SUN5Q8TC36 379 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 DTD1Q8TEA8 209 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 HYPMO75409 117 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MT-ND4LP03901 98 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 RAB5BP61020 215 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 HCP5Q6MZN7 132 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF525Q8N782 197 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SRRQ9GZT4 340 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 UBE2L6O14933 153 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ADIRFQ15847 76 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TMUB2Q71RG4 321 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC6Q9BQY6 131 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 KCNK15Q9H427 330 aa8.75□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SYNGR2O43760 224 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 RAB5CP51148 216 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ERVS71-1P61550 626 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 XAF1Q6GPH4 301 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 HOGA1Q86XE5 327 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM123Q8N131 208 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SNURFLB1AK76 121 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FCGR3AP08637 254 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FAM122BQ7Z309 247 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 STHQ8IWL8 128 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZMAT4Q9H898 229 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SNAPINO95295 136 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 AQP3Q92482 292 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MITD1Q8WV92 249 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 DYRK2Q92630 601 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.74□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SELENOTP62341 195 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SLC35E4Q6ICL7 350 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 WDFY2Q96P53 400 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TECTAO75443 2155 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SOX15O60248 233 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CELA3BP08861 270 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 RD3LP0DJH9 198 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 POC1AQ8NBT0 407 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 H3BUX3 64 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 IGHV3-11P01762 117 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 G6PCP35575 357 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FOXL1Q12952 345 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF154Q13106 437 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 PPP1R1AQ13522 171 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CTF1Q16619 201 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FAM201AQ5SY85 155 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ARPC1AQ92747 370 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 LURAP1Q96LR2 239 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 UMAD1C9J7I0 102 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 GLIPR1P48060 266 aa8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf170A2RU37 121 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 CTDSPLO15194 276 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 KPTNQ9Y664 436 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 SLC31A2O15432 143 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FDX2Q6P4F2 183 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 TVP23CQ96ET8 276 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 DOCK7Q96N67 2140 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.72□□□□□ -1.01
POLR1B-217ENST00000541869 HSF4Q9ULV5 492 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms