RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 ETV6P41212 452 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 BLCAPP62952 87 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 DYRK1AQ13627 763 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 EBI3Q14213 229 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8N2B8 174 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52I2Q8NH67 350 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 SMIM4Q8WVI0 70 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 S1PR3Q99500 378 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 KLK11Q9UBX7 282 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF221Q9UK13 617 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 U3KQK5 164 aa6.91□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 PROP1O75360 226 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8U9P0C7N5 309 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM106CPP0CH98 169 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 TBPP20226 339 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 HRH1P35367 487 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR12P47775 334 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR3A3P47888 321 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 REG1BP48304 166 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 DGCR2P98153 550 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 CD83Q01151 205 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 MSMO1Q15800 293 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 ACTBL2Q562R1 376 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 MOB3BQ86TA1 216 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 DRAM1Q8N682 238 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8U1Q8NH10 309 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR56B4Q8NH76 319 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 NABP2Q9BQ15 211 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2D2Q9H210 308 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 EHFQ9NZC4 300 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF150Q9ULK6 438 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 V9GYH0 126 aa6.9□□□□□ -1.3
CLSTN3-212ENST00000541770 COL7A1Q02388 2944 aa6.9□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2F2O95006 317 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PPYP01298 95 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PMP2P02689 132 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CD74P04233 296 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 FCER2P06734 321 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CT45A6P0DMU7 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CT45A5P0DMU8 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CT45A7P0DMV0 189 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 HLA-DMAP28067 261 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 FCGR2CP31995 323 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 RFX2P48378 723 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 LSAMPQ13449 338 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF79Q15937 498 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CAPSLQ8WWF8 208 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5H14A6NHG9 310 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 H0YJW9 148 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 C3orf84H3BNL1 204 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 MOSP00540 346 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1D-33P01593 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1-33P01594 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV2-14P01704 120 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CD3DP04234 171 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 AADACP22760 399 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CD24P25063 80 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 MC5RP33032 325 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TAS2R19P59542 299 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms