RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PSMB3P49720 205 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PPOXP50336 477 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 BAXQ07812 192 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 UNC119Q13432 240 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TESK1Q15569 626 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 BSXQ3C1V8 233 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GCSAMLQ5JQS6 135 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LIAT1Q6ZQX7 453 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZT83 130 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SFTPA2Q8IWL1 248 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC18Q8N456 261 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR6X1Q8NH79 312 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FRZBQ92765 325 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 RNF126Q9BV68 326 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 GPR173Q9NS66 373 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FBLN5Q9UBX5 448 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 POLEQ07864 2286 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CD5P06127 495 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF708P17019 499 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 DLK1P80370 383 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FHL1Q13642 323 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNMB1Q16558 191 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PCSK4Q6UW60 755 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 BTNL8Q6UX41 500 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C10orf35Q96D05 121 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SMIM7Q9BQ49 75 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C7orf69Q9H7B7 122 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM206AQ9NX38 181 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PPIAL4DF5H284 164 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 H0YIZ8 118 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 RER1O15258 196 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CA11O75493 328 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 DBHP09172 617 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFB7P17568 137 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CD200P41217 278 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HTR5AP47898 357 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TAS2R30P59541 319 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZP4Q12836 540 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8G5Q8NG78 346 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PIGCQ92535 297 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SFRP2Q96HF1 295 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 DOK5Q9P104 306 aa3.35□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CST7O76096 145 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CDAP32320 146 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 NPBWR2P48146 333 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 NHLH2Q02577 135 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MSMO1Q15800 293 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 IQCJQ1A5X6 159 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 KHDC3LQ587J8 217 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 LCN15Q6UWW0 184 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 SLC35E3Q7Z769 313 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MKXQ8IYA7 352 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 OSR2Q8N2R0 312 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 WFDC12Q8WWY7 111 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 R3HDM4Q96D70 268 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C2orf88Q9BSF0 95 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 V9GYS6 101 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FREM3P0C091 2139 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 MPDZO75970 2070 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A1W2PNR3 127 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 TNFSF12O43508 249 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 RAMP3O60896 148 aa3.34□□□□□ -1.87
ANKRD28-213ENST00000498524 PITX3O75364 302 aa3.34□□□□□ -1.87
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