RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	VSIR	Q9H7M9	311 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	GP6	Q9HCN6	339 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ENY2	Q9NPA8	101 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMPX	Q9UHP9	88 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXorf1	O96002	111 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	LHX2	P50458	406 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	DMWD	Q09019	674 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8B8	Q15620	311 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAPT	Q8N292	157 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAT6	Q93015	286 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPX	Q9BT56	116 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNAI2	O43623	268 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNF	P01375	233 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHG1	P01857	330 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MGAT2	Q10469	447 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIR3DS1	Q14943	382 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZIC1	Q15915	447 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF525	Q8N782	197 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSKU	Q8WUA8	353 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYB561	P49447	251 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4A5	Q8NH83	315 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM45B	Q96B21	275 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	HARBI1	Q96MB7	349 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	BGLAP	P02818	100 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	METAP1	P53582	386 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ID3	Q02535	119 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OSR2	Q8N2R0	312 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPSB4	Q96A44	273 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	hDV102S1	A0JD36	115 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549		B5MCH6	92 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CATR1	Q13166	79 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MGAM	O43451	1857 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMPRSS2	O15393	492 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	YPEL1	O60688	119 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAPSA	O96009	420 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MFAP5	Q13361	173 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	BCORP1	Q8N888	145 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	RLN3	Q8WXF3	142 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	YPEL2	Q96QA6	119 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0Y980	276 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDCD6	O75340	191 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM215	Q68D42	235 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYO9B	Q13459	2157 aa		7	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	UTS2	O95399	124 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOM	O95445	188 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	EML2	O95834	649 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP5G3	P48201	142 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	NMU	P48645	174 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4C3	Q8NH37	302 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8orf44	Q96CB5	159 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0A6YYD4	124 aa		6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELA3A	P09093	270 aa		6.99	□□□□□ -1.29

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