RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CKS2P33552 79 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RABAC1Q9UI14 185 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 REC114Q7Z4M0 266 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSPB7Q9UBY9 170 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL31P62899 125 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POC1AQ8NBT0 407 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PARLQ9H300 379 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR54Q9H977 334 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGPA6NDG6 321 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.78□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PQLC2LA1A4F0 135 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERGP11308 486 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNC119Q13432 240 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOLR2P14207 255 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSTR5P35346 364 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAS1LP35410 378 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM187Q14656 261 aa14.77□□□□□ -0.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPIPB9F8W1W9 429 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LEMD1Q68G75 181 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PILRAQ9UKJ1 303 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPAG17Q6Q759 2223 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLL1O00548 723 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZP1P60852 638 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.77□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MGST3O14880 152 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUBP1P53384 320 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATOH7Q8N100 152 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL13Q99616 98 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF714Q96N38 554 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A10PA6NDY2 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A18PA6NE21 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A16PA6NEW6 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A7PA6NKC0 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A22PA8MWA6 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A12PA8MX19 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C21orf140B9A014 251 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A15PP0C7V4 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A13PP0C7W8 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A14PP0C7W9 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A24PP0C7X0 464 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TGIF1Q15583 401 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UCP2P55851 309 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TET1Q8NFU7 2136 aa14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIAL4DF5H284 164 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZG16O60844 167 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD8AP01732 235 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNFRSF9Q07011 255 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCP4P48539 62 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H4GQ99525 98 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM177Q53S58 311 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCP5Q6MZN7 132 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ID1P41134 155 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.75□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C4orf51C9J302 202 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRYBB3P26998 211 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SFRP2Q96HF1 295 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GUCD1Q96NT3 240 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CELA2AP08217 269 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADIPOQQ15848 244 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEU1Q99519 415 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SELENOTP62341 195 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR8G5Q8NG78 346 aa14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q96M66 194 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms