RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 SSSCA1O60232 199 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZG16O60844 167 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO24O75426 580 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 S1PR2O95136 353 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN14O95500 239 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 M6PRP20645 277 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TNFSF4P23510 183 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 S100GP29377 79 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CHRNB4P30926 498 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SULT1A1P50225 295 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CAV2P51636 162 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00205P59089 165 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SELENOVP59797 346 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF9Q07011 255 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 POU2AF1Q16633 256 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CT45A1Q5HYN5 189 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ADAM5Q6NVV9 412 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF525Q8N782 197 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 OR10A7Q8NGE5 316 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CT45A3Q8NHU0 189 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RFESDQ8TAC1 157 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 NEUROG1Q92886 237 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SH3BGRL3Q9H299 93 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CLN8Q9UBY8 286 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RNF150Q9ULK6 438 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM218A2RU14 115 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC30A6NM36 301 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 C9JQL5 133 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS46E5RG02 174 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM77I1YAP6 450 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SCO1O75880 301 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MMP23AO75900 390 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CRYZL1O95825 349 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN1O95832 211 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 PLAUP00749 431 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ARG1P05089 322 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR8U8P0C7N1 319 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 TNFRSF1AP19438 455 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V0CP27449 155 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RAB5CP51148 216 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DYNLT3P51808 116 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGDIBP52566 201 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 BLOC1S1P78537 153 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CCL8P80075 99 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TLE1Q04724 770 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CATR1Q13166 79 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 EDDM3AQ14507 147 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 VWC2Q2TAL6 325 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 Q3ZCU0 254 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ATRAIDQ6UW56 229 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 OR4C12Q96R67 309 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP5SQ99766 215 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 CTSZQ9UBR2 303 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RFNGQ9Y644 331 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00312Q9Y6C7 94 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RELNP78509 3460 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087X0M5 115 aa4.63□□□□□ -1.67
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