RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR27Q6MZM9 219 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 Q96M66 194 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 LHFPL6Q9Y693 200 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ODAMA1E959 279 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RER1O15258 196 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PAGE4O60829 102 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PPYP01298 95 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IAPPP10997 89 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PMCHP20382 165 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4A47Q6IF82 309 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DOK3Q7L591 496 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A18H0YCH9 400 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ESDP10768 282 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 AMTP48728 403 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A18Q3C1V0 323 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NMSQ5H8A3 153 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD3Q8WU67 409 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NRN1Q9NPD7 142 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RP1P56715 2156 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0J9YY10 115 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5B21A6NL26 309 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF212BA8MTL3 300 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 B4DGG1 531 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 VENTXO95231 258 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CRYAAP02489 173 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GPX1P07203 203 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NPPCP23582 126 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 RAET1LQ5VY80 246 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF525Q8N782 197 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DDIT4LQ96D03 193 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM12Q96EX1 92 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM56Q96MV1 263 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 K7ERU9 68 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPB7O75200 414 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 VDAC1P21796 283 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 CD38P28907 300 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 WASP42768 502 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TIRAPP58753 221 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 SERF2P84101 59 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT7Q11130 342 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXL1Q12952 345 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DTX1Q86Y01 620 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF114Q8NC26 417 aa7.13□□□□□ -1.27
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RABGEF1-203ENST00000439720 DERL1Q9BUN8 251 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 R4GN57 208 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRA5A6NI73 299 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM166BA8MTA8 275 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BMH7 237 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 M0QXV9 152 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF253O75346 499 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TIAF1O95411 115 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 NRASP01111 189 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 KRASP01116 189 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFA4P12838 97 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 GLB1P16278 677 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 ACP1P24666 158 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PSG4Q00888 419 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MFAP5Q13361 173 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM177Q53S58 311 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 LYZL4Q96KX0 146 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC7A10Q9NS82 523 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.12□□□□□ -1.27
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