RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.73□□□□□ -0.05
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PTPRF-209ENST00000438120 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.066e-7■■□□□ 11.8
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PTPRF-209ENST00000438120 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.68□□□□□ -0.06
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PTPRF-209ENST00000438120 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-209ENST00000438120 CKS2P33552 79 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRF-209ENST00000438120 MFAP4P55083 255 aa14.68□□□□□ -0.06
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