RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV3-15P01624 115 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00869P0C866 280 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN8OSP0DMR3 200 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB7P17568 137 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM217Q8N7C4 229 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIN2AQ99865 258 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM9BQ9NQ34 198 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GV50 99 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC30A6NM36 301 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CTXN2P0C2S0 81 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SSTP61278 116 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS18P62269 152 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 GNMTQ14749 295 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2T2Q6IF00 324 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MOB1BQ7L9L4 216 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 DFFBO76075 338 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 COX5AP20674 150 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2KP61086 200 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TREML4Q6UXN2 200 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZWC4 215 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1K1Q8NGR3 316 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNE4Q8WWG9 221 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 HES7Q9BYE0 225 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PXMP4Q9Y6I8 212 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CGAP01215 116 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CELA3BP08861 270 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL15P1P0C7V9 234 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 GPM6AP51674 278 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ELLP55199 621 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SOX8P57073 446 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RELBQ01201 579 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 POU2AF1Q16633 256 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM214BQ7L5A3 538 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM58AQ8N1B3 248 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 GBGT1Q8N5D6 347 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR31Q8NA23 367 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 METRNQ9UJH8 293 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 K7EN84 100 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2H2O95918 312 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TFF3Q07654 80 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MALLQ13021 153 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF439Q8NDP4 499 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FCN1O00602 326 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TGOLN2O43493 480 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CD1BP29016 333 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 RAET1LQ5VY80 246 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCF1Q9UBD9 225 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R036 132 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR3A1P47881 315 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVS71-1P61550 626 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 TLE1Q04724 770 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1P1Q8NH06 330 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51H1Q8NH63 302 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR7Q8TB68 274 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 MYCNOSP40205 109 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF718Q3SXZ3 478 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf194Q5T5A4 169 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10V1Q8NGI7 309 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PCGF1Q9BSM1 259 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 PLK3Q9H4B4 646 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF442Q9H7R0 627 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 C2CD3Q4AC94 2353 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 NPIPA3F8WFD2 350 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CYB5BO43169 146 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 FABP4P15090 132 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD18P57730 90 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 LCN15Q6UWW0 184 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD2Q86X83 199 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 IL17BQ9UHF5 180 aa3□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP92A6NM28 416 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 SCGB1D2O95969 90 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA10P01566 189 aa2.99□□□□□ -1.93
PGGT1B-203ENST00000419445 IGLV1-44P01699 117 aa2.99□□□□□ -1.93
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