RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 RFX2P48378 723 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 F2RL1P55085 397 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 C15orf40Q8WUR7 153 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 GIMAP1Q8WWP7 306 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 EHFQ9NZC4 300 aa21.53■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 IGLV2-14P01704 120 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 HLA-DMAP28067 261 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 MC5RP33032 325 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 TAS2R46P59540 309 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF645Q8N7E2 425 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 Q8N9W7 124 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 OR5H2Q8NGV7 314 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 KLK11Q9UBX7 282 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.52■■□□□ 1.04
GNPTAB-202ENST00000392919 PPYP01298 95 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 HRH1P35367 487 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ACTBP60709 375 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 DYRK1AQ13627 763 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 DHRS11Q6UWP2 260 aa21.51■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 SOSTQ9BQB4 213 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 WNT10AQ9GZT5 417 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 MTFP1Q9UDX5 166 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 WASHC3Q9Y3C0 194 aa21.51■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXO24O75426 580 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 CNTFRP26992 372 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 DGCR2P98153 550 aa21.5■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 GABARAPH6UMI1 98 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 H7C2Y5 167 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC22A5O76082 557 aa21.49■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 IL18Q14116 193 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 FCAMRQ8WWV6 532 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 RABL2BQ9UNT1 228 aa21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 CTDSPLO15194 276 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 RBBP9O75884 186 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 OPN1MWP04001 364 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 OPN1MW2P0DN77 364 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 OPN1MW3P0DN78 364 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 THBS3P49746 956 aa21.48■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 MMDQ15546 238 aa21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 C9orf152Q5JTZ5 239 aa21.48■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 LINC00473A8K010 186 aa21.47■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 G3V4G9 280 aa21.47■■□□□ 1.03
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GNPTAB-202ENST00000392919 IGKV1-16P04430 117 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 FXYD4P59646 89 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 NPBQ8NG41 125 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 SECTM1Q8WVN6 248 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 DDB2Q92466 427 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 CCL28Q9NRJ3 127 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC35D1Q9NTN3 355 aa21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 PEX14O75381 377 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 PDPNQ86YL7 162 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 SMIM4Q8WVI0 70 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 ADTRPQ96IZ2 230 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 PLXNB1O43157 2135 aa21.46■■□□□ 1.03
GNPTAB-202ENST00000392919 FABP12A6NFH5 140 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 NBR2O15453 112 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 NDUFA3O95167 84 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 RPL30P62888 115 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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GNPTAB-202ENST00000392919 BVESQ8NE79 360 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 RNF5Q99942 180 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 RASL11BQ9BPW5 248 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC5A7Q9GZV3 580 aa21.45■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 M0QYG6 137 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 IGHG2P01859 326 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 HERV-K104P61576 105 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 ACTBL2Q562R1 376 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 VAX1Q5SQQ9 334 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 OR6F1Q8NGZ6 308 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 MOB3AQ96BX8 217 aa21.44■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 LINC01548A6NM66 108 aa21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 CD3DP04234 171 aa21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 S100A5P33763 92 aa21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 C5orf64Q2M2E5 130 aa21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM17Q86X19 198 aa21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM229BQ8NBD8 167 aa21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 A6NHS1 94 aa21.42■■□□□ 1.02
GNPTAB-202ENST00000392919 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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