RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 SLC17A3O00476 420 aa18.34■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 GNB1LQ9BYB4 327 aa18.34■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 ZNF83P51522 516 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 VWC2Q2TAL6 325 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 OR10J3Q5JRS4 329 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 PARM1Q6UWI2 310 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 OR5B3Q8NH48 314 aa18.33■□□□□ 0.53
OPN3-201ENST00000366554 IGLC7A0M8Q6 106 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 PSG7Q13046 419 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 NIT1Q86X76 327 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 Q8N7P7 452 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RAB1CQ92928 201 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RCHY1Q96PM5 261 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 VPS25Q9BRG1 176 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa18.33■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 NPIPA2E9PIF3 369 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 NPIPA3F8WFD2 350 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 GDF9O60383 454 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 TMEM92Q6UXU6 159 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 FGFRL1Q8N441 504 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 PNKDQ8N490 385 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 LMX1AQ8TE12 382 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 GFRA1P56159 465 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RHOGP84095 191 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 UCN2Q96RP3 112 aa18.32■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 PATE4P0C8F1 98 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ZNF32P17041 273 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 PMCHP20382 165 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 CSTL1Q9H114 145 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 A0A1B0GX78 115 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 K7EN84 100 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 WDR1O75083 606 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RPS20P60866 119 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 NOGQ13253 232 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MAJINQ3KP22 176 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OCIAD2Q56VL3 154 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR5A2Q8NGI9 324 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 TXNDC17Q9BRA2 123 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR1A1Q9P1Q5 309 aa18.31■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 GCSAMLQ5JQS6 135 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RNF208Q9H0X6 261 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 CST9LQ9H4G1 147 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ZNF407Q9C0G0 2248 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 GON4LQ3T8J9 2241 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 SCO2A0A1W2PP80 73 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 S1PR2O95136 353 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 FAM69BQ5VUD6 431 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MTCH1Q9NZJ7 389 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 CLN8Q9UBY8 286 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 REV3LO60673 3130 aa18.3■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MYO15AQ9UKN7 3530 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 C17orf112F2Z3M2 114 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 VAMP5O95183 116 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 FADS6Q8N9I5 356 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 DCAF12Q5T6F0 453 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MMD2Q8IY49 270 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MUC15Q8N387 334 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR2M7Q8NG81 312 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 CORO2AQ92828 525 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RNF24Q9Y225 148 aa18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 ATOH7Q8N100 152 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 IL1F10Q8WWZ1 152 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR5B21A6NL26 309 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 CA2P00918 260 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 VAMP3Q15836 100 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 C19orf35Q6ZS72 473 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 OR56B2PQ8NGI1 322 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 SPSB4Q96A44 273 aa18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 A0A1W2PRS3 328 aa18.27■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 RPL19P84098 196 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 NAT8BQ9UHF3 227 aa18.27■□□□□ 0.52
OPN3-201ENST00000366554 MT-ND6P03923 174 aa18.27■□□□□ 0.51
OPN3-201ENST00000366554 TMEM11P17152 192 aa18.27■□□□□ 0.51
OPN3-201ENST00000366554 ARL4DP49703 201 aa18.27■□□□□ 0.51
OPN3-201ENST00000366554 RPEL1Q2QD12 228 aa18.27■□□□□ 0.51
OPN3-201ENST00000366554 IFI44Q8TCB0 444 aa18.27■□□□□ 0.51
OPN3-201ENST00000366554 TMEM204Q9BSN7 226 aa18.27■□□□□ 0.51
OPN3-201ENST00000366554 IL23AQ9NPF7 189 aa18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms