RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.81□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 UPRTQ96BW1 309 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF479Q96JC4 524 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 SUCNR1Q9BXA5 334 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 MMP28Q9H239 520 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 C5orf66Q9H5L9 145 aa4.81□□□□□ -1.64
PDE4D-202ENST00000317118 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 DHFRP00374 187 aa4.8□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 LTC4SQ16873 150 aa4.8□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 TBX15Q96SF7 602 aa4.8□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.8□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 OOSP1A8MZH6 123 aa4.8□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.79□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.79□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 CITED1Q99966 193 aa4.79□□□□□ -1.64
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PDE4D-202ENST00000317118 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa4.79□□□□□ -1.64
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