RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598938.1

LIG1-216, Transcript of DNA ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene LIG1, Length 377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1-216ENST00000598938 PROP1O75360 226 aa14.56□□□□□ -0.08
LIG1-216ENST00000598938 OR5H8P0DN80 308 aa14.56□□□□□ -0.08
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LIG1-216ENST00000598938 ACTBP60709 375 aa14.56□□□□□ -0.08
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LIG1-216ENST00000598938 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIG1-216ENST00000598938 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
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LIG1-216ENST00000598938 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIG1-216ENST00000598938 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.5□□□□□ -0.09
LIG1-216ENST00000598938 MOB3AQ96BX8 217 aa14.5□□□□□ -0.09
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