RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	WISP2	O76076	250 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	FGF2	P09038	288 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	STUM	Q69YW2	141 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291		Q6ZS92	163 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR4F5	Q8NH21	305 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	LIME1	Q9H400	295 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	ABCA1	O95477	2261 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	IGSF23	A1L1A6	192 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	COX7A1	P24310	79 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PRSS33	Q8NF86	280 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	DBX1	A6NMT0	343 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PITX3	O75364	302 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	UBE2G2	P60604	165 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MED9	Q9NWA0	146 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A1W2PPH5	198 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	DAO	P14920	347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	NQO2	P16083	231 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	UCN	P55089	124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	BIN3	Q9NQY0	253 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	TCF15	Q12870	199 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	BTBD17	A6NE02	478 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MLNR	O43193	412 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR2C1	O95371	312 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	RND3	P61587	244 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	C18orf12	Q96KH6	178 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.78	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	CNIH1	O95406	144 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	BSPH1	Q075Z2	132 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	LINC01560	Q8TB33	94 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.77	□□□□□ -0.68
NFE2L1-222	ENST00000585291	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RHOV	Q96L33	236 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	MB	P02144	154 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	LGALS4	P56470	323 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	IL22RA2	Q969J5	263 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	C17orf98	A8MV24	154 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	HERPUD1	Q15011	391 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM209A	Q5JX71	171 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RBKS	Q9H477	322 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RAX	Q9Y2V3	346 aa		10.77	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RTP5	Q14D33	572 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM56	Q96MV1	263 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A1W2PRD5	423 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A1W2PRF3	423 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291		A0A1W2PRM7	423 aa		10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
NFE2L1-222	ENST00000585291	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms