RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBLN7Q53RD9 439 aa26.51■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AKR1E2Q96JD6 320 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOSTQ9BQB4 213 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 EHFQ9NZC4 300 aa26.51■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROP1O75360 226 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCGR2CP31995 323 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2F2O95006 317 aa26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RFX2P48378 723 aa26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GIMAP1Q8WWP7 306 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A33Q9BSK2 321 aa26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM89A2RUT3 159 aa26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DGCR2P98153 550 aa26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DYRK1AQ13627 763 aa26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T10Q8NGZ9 312 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP26.49■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 BATF3Q9NR55 127 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 J3QRK9 145 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA7O95182 113 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 CT45A6P0DMU7 189 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 CT45A5P0DMU8 189 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 CT45A7P0DMV0 189 aa26.48■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A5O76082 557 aa26.47■■□□□ 1.83
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF645Q8N7E2 425 aa26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOSP00540 346 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV1-13P0DP09 117 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 AADACP22760 399 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAG2P55895 527 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXL1Q12952 345 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 HNF4GQ14541 408 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACTBL2Q562R1 376 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS11Q6UWP2 260 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC190Q86UF4 302 aa26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5H14A6NHG9 310 aa26.45■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R1X1 148 aa26.45■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZSV7 163 aa26.45■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa26.45■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4F5Q8NH21 305 aa26.45■■□□□ 1.83
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN9O75954 239 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5AN1Q8NGI8 311 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 V9GYH0 126 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBPP20226 339 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 MC5RP33032 325 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPANXN2Q5MJ10 180 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N6K4 173 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4C13Q8NGP0 309 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf30Q96GV9 206 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOB4Q9Y3A3 225 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YJW9 148 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0QZK8 103 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETV6P41212 452 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 VAX1Q5SQQ9 334 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR6F1Q8NGZ6 308 aa26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.825e-14■□□□□ 9.8
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF383Q8NA42 475 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM229BQ8NBD8 167 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV2-14P01704 120 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD3DP04234 171 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R19P59542 299 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 FXYD4P59646 89 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 HERV-K104P61576 105 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN5P62079 268 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 SECTM1Q8WVN6 248 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf95Q9H693 158 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 WASHC3Q9Y3C0 194 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR8H1Q8NGG4 311 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEX1Q9HBH7 125 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R8Q9NYW2 309 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GUS0 222 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF16O43320 207 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC00205P59089 165 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSMO1Q15800 293 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF79Q15937 498 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNPY1Q3B7I2 92 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 MOB3AQ96BX8 217 aa26.39■■□□□ 1.82
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
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