RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 LHFPL1Q86WI0 220 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 OR4K15Q8NH41 348 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT15Q9NV35 164 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF222Q9UK12 451 aa7.4□□□□□ -1.22
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR2AT4A6NND4 320 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF737O75373 536 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 DHFRP00374 187 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 TFF1P04155 84 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 AMY2AP04746 511 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 IL5P05113 134 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 FCER2P06734 321 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 CTXN2P0C2S0 81 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF44P15621 663 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 AMY2BP19961 511 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DMAP28067 261 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 MYCNOSP40205 109 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 CCR6P51684 374 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 TATDN3Q17R31 274 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf152Q5JTZ5 239 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR52W1Q6IF63 320 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM17Q86X19 198 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 CADM3Q8N126 398 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNRF1Q8ND25 227 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR51S1Q8NGJ8 323 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 TERB2Q8NHR7 220 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 SDSLQ96GA7 329 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF286AQ9HBT8 521 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 Q9N2K0 584 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 C19orf12Q9NSK7 152 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 MCUBQ9NWR8 336 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 LYSTQ99698 3801 aa7.39□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0B4J293 547 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2QL1A1L167 161 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 PSMB11A5LHX3 300 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 M0QYG6 137 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 PSPNO60542 156 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 IFNA6P05013 189 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 PSG2P11465 335 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 DUSP1P28562 367 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 PRDX2P32119 198 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR3A3P47888 321 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 DYNLT3P51808 116 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 FAAP20Q6NZ36 180 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF561Q8N587 486 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 GIMAP1Q8WWP7 306 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 SNX22Q96L94 193 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.38□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 TRDCB7Z8K6 153 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 K7N7A8 449 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 OR3A1P47881 315 aa7.37□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SMAD3-215ENST00000560424 ARHGDIBP52566 201 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms