RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	OR8U9	P0C7N5	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RRAS	P10301	218 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OMG	P23515	440 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	UCP1	P25874	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HTR1D	P28221	377 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MC5R	P33032	325 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	KIR2DS2	P43631	304 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	THBS3	P49746	956 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GNMT	Q14749	295 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR8U1	Q8NH10	309 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MITD1	Q8WV92	249 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ASB13	Q8WXK3	278 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM230	Q96A57	120 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	AJUBA	Q96IF1	538 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C18orf12	Q96KH6	178 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM56	Q96MV1	263 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	F8	P00451	2351 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379		H0Y980	276 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TOR1A	O14656	332 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IGHV1-69	P01742	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR4E1	P0C645	316 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SLC25A6	P12236	298 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	EPHA1	P21709	976 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CD1B	P29016	333 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PIGP	P57054	158 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CATR1	Q13166	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	DHRS2	Q13268	280 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	LYG2	Q86SG7	212 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	FAM219A	Q8IW50	185 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PRR18	Q8N4B5	295 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR2D2	Q9H210	308 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ING3	Q9NXR8	418 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	HIVEP1	P15822	2718 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	MTOR	P42345	2549 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SLC31A2	O15432	143 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SFT2D2	O95562	160 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TGFA	P01135	160 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CT45A6	P0DMU7	189 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CT45A5	P0DMU8	189 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	CT45A7	P0DMV0	189 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	ANXA3	P12429	323 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	NFYB	P25208	207 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	GPR12	P47775	334 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	LGALS7	P47929	136 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	RAB13	P51153	203 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM187	Q14656	261 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TATDN3	Q17R31	274 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM177	Q53S58	311 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	UTF1	Q5T230	341 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	PDPN	Q86YL7	162 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		6.22	□□□□□ -1.41
RNF41-208	ENST00000550379	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41

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