RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	OR2C3	Q8N628	320 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM68	Q96MH6	324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	AK3	Q9UIJ7	227 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997		A6NJY4	79 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	GCG	P01275	180 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	FABP4	P15090	132 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	FRZB	Q92765	325 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BRF1-208	ENST00000546997	OPN1MW	P04001	364 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CD40	P25942	277 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CCL20	P78556	96 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	BAX	Q07812	192 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CALHM1	Q8IU99	346 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OSR2	Q8N2R0	312 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997		H0YL77	283 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TCAP	O15273	167 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CRYAA	P02489	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RAB4A	P20338	218 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MPV17	P39210	176 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	HAGH	Q16775	308 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	BRICD5	Q6PL45	260 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MISP3	Q96FF7	219 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	DIRAS3	O95661	229 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PRDX4	Q13162	271 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	BSPH1	Q075Z2	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PIGY	Q3MUY2	71 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1B0GU03	582 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PSG7	Q13046	419 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	P2RX4	Q99571	388 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		13.87	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LRBA	P50851	2863 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RAC2	P15153	192 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OR8G1	Q15617	311 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SSX8	Q7RTT4	187 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997		Q8NFD4	153 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MOB3A	Q96BX8	217 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	GZMB	P10144	247 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CD200	P41217	278 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	FABP6	P51161	128 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19

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